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科学家研发出新病原体抗原性计算平台

2018-05-08 中国科学报 黄辛
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  上海市公共卫生临床中心、复旦大学生物医学研究院教授徐建青课题组和同济大学生命科学与技术学院教授曹志伟课题组合作,成功研发了一个新的病原体抗原性计算平台。相关研究成果近日在线发表于《自然—通讯》。

  研究人员设计了一个空间免疫表位比对工具CE-BLAST,以高效计算不同病原体之间的抗原性距离。与以往的计算方法相比,CE-BLAST最大的优势在于可以不需要借助于实验数据作为训练内容来构建模型,这对于一些还缺少实验数据的新病原体而言以及新暴发的传染性疾病(例如寨卡病毒)而言尤为关键。

  据介绍,研究人员在病毒亚型内不同毒株间(甲型流感病毒H3N2亚型),病毒不同亚型之间(登革病毒不同血清型),跨病毒(黄病毒科登革病毒及寨卡病毒)这三个层面上依次验证了方法的有效性。研究人员还利用CE-BLAST构建出了一株广谱抗甲型流感病毒H3N2亚型不同毒株的疫苗,并在动物实验上得到很好的保护谱范围。

  “这种方法计算出寨卡与登革热病毒存在高度相似的抗体表位,现有的登革热疫苗有潜在交叉预防寨卡病毒的作用。”徐建青表示,该方法有望设计出针对新发病毒具有交叉保护作用的新型疫苗。

打印 责任编辑:侯茜

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