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美国密歇根大学学者到昆明动物所交流

2015-06-15 昆明动物研究所
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  6月11日上午,美国密歇根大学杨建荣和陈小舒应邀到中国科学院昆明动物研究所进行学术交流,并作了两场精彩的学术报告。

  杨建荣作了题为Biological significance of stochastic errors的学术报告。之前的研究发现不同基因的蛋白质序列进化速率差别很大,表达量越高,进化速率越低,然而具体的制约机制并不清楚。杨建荣通过计算机模拟和基因组数据发现:高表达的蛋白质表面更倾向于使用不容易和其他蛋白结合的氨基酸,而低表达的基因则没有这个限制,从而导致高表达基因进化速率较慢。该研究成果以第一作者发表在Molecular Systems BiologyPNAS杂志上。随后,他又通过数学模型推导综合分析多种不同类型基因组高通量测序数据,并设计实验验证发现:细胞是通过mRNA二级结构对翻译的准确率和错误率间的平衡进行精细调控。该研究成果以第一作者发表在PLoS Biology杂志,并入选该刊的每周精选。

  陈小舒作了题为The factors underlying intra-genomic variation of mutation rate的学术报告。突变,是遗传多样性和进化的原始来源,它的出现既会产生有利的影响,也会导致不良性状或者疾病的发生。陈小舒深入分析了核小体、转录水平和新生RNA折叠对突变率的影响。该研究结果以第一作者发表在Science、Mol Biol Evol、PNAS等国际知名杂志上。

    报告结束后,杨建荣和陈小舒与研究所多位PI进行了深入的交谈,为今后双方的合作奠定了基础。

    杨建荣研究方向主要以计算生物学的手段从进化和基因组的角度分析生命活动过程中出现的各种随机错误,及其对生物造成的影响等。陈小舒研究方向主要是试图探索影响真核基因组遗传和表型变异率的分子基础,及其对人类疾病的影响等。

打印 责任编辑:陈丹

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