加快打造原始创新策源地,加快突破关键核心技术,努力抢占科技制高点,为把我国建设成为世界科技强国作出新的更大的贡献。

——习近平总书记在致中国科学院建院70周年贺信中作出的“两加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向经济主战场、面向国家重大需求、面向人民生命健康,率先实现科学技术跨越发展,率先建成国家创新人才高地,率先建成国家高水平科技智库,率先建设国际一流科研机构。

——中国科学院办院方针

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天津工生所发布反应酶挖掘与评估平台

2024-06-17 天津工业生物技术研究所
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在代谢路径设计领域,寻找能够催化非天然反应的候选酶是具有挑战性的工作。虽然现有一些方法可以根据相似反应识别潜在酶,但在反应类型识别和后续酶筛选评估等方面存在不足,难以有效帮助实验科学家快速筛选候选酶进行实验验证。

近日,中国科学院天津工业生物技术研究所生物设计中心发布了集成的反应酶挖掘与评估平台——REMEhttps://reme.biodesign.ac.cn)。该平台结合底物原子到产物原子映射、原子类型变化识别和反应相似性计算,实现了相似反应的计算、快速排序和可视化。用户可以根据功能基团筛选相似反应,并进一步通过酶号或序列同源性筛选或扩展候选酶。REME平台结合多种人工智能方法对候选酶进行多角度评估,帮助科研人员迅速识别潜在酶。REME平台为非天然反应的酶挖掘和评估提供了新的解决方案。

相关研究成果发表在《核酸研究》(Nucleic Acids Research上。研究工作得国家自然科学基金、中国科学院战略性先导科技专项、天津市合成生物技术创新能力提升行动专项及合成生物学海河实验室创新基金等的支持。

论文链接

反应酶挖掘与评估平台

打印 责任编辑:侯茜

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