由于长期淹水状态，稻田成为温室气体甲烷的重要排放源。事实上，稻田土壤产生的甲烷，大部分在排放到空气前已被好氧甲烷氧化菌所氧化。而好氧甲烷氧化菌可分为I型和II型两个类群。它们具有不同的生理生态特性和代谢差异。甲烷被甲烷氧化菌氧化过程中，一部分碳被氧化成CO2排放到空气中，另一部分被转为微生物细胞物质并最终进入土壤成为SOC。而后者较少引起关注。目前，两类甲烷氧化菌在稻田土壤甲烷碳转化的相对贡献及作用机制尚不清楚。阐释稻田土壤中甲烷碳转化的微生物机制，对于预测稻田生态系统甲烷排放和碳循环具有重要意义。 中国科学院亚热带农业生态研究所流域农业环境研究中心研究员吴金水团队，沿我国东部水稻分布区选择四个气候带（中温带、暖温带、亚热带和热带）采集典型稻田土壤样品（每个气候带选择6个稻田土壤），分析甲烷氧化菌群落特征，并设置13CH4示踪模拟培养试验，测定土壤甲烷氧化速率和甲烷碳转化效率。结果表明，与热带和亚热带酸性稻田土壤相比，暖温带碱性稻田土壤甲烷氧化速率和碳转化效率更高，主要是甲烷氧化菌生态位分化和代谢差异所致。热带和亚热带低pH值土壤更适宜II型甲烷氧化菌，而暖温带高pH值土壤更适宜I型甲烷氧化菌。I型甲烷氧化菌通过RuMP碳同化途径，比II型甲烷氧化菌通过丝氨酸途径，具有更高的碳转化效率。基于13C同位素磷脂脂肪酸（PLFA）分析结果进一步支撑了这一观点，I型甲烷氧化菌代表性C16PLFA中13C丰度和含量，高于II型甲烷氧化菌代表性C18PLFA中13C丰度和含量。科研人员据此得出结论：I型甲烷氧化菌在稻田土壤甲烷氧化和甲烷碳转化过程中起到主导作用。因此，在全球气候变化背景下，有必要将特殊的功能微生物类群（如甲烷氧化菌）纳入温室气体排放预测和土壤碳通量估算模型。 近期，相关研究成果以Type I methanotrophs dominated methane oxidation and assimilation in rice paddy fields by the consequence of niche differentiation为题，发表在《土壤生物学与肥力》（Biology and Fertility of Soil）上。研究工作得到国家重点研发计划和国家自然科学基金等的支持。论文链接四个气候区稻田土壤甲烷氧化速率和碳转化效率稻田土壤甲烷碳转化的微生物机制