加快打造原始创新策源地,加快突破关键核心技术,努力抢占科技制高点,为把我国建设成为世界科技强国作出新的更大的贡献。

——习近平总书记在致中国科学院建院70周年贺信中作出的“两加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向经济主战场、面向国家重大需求、面向人民生命健康,率先实现科学技术跨越发展,率先建成国家创新人才高地,率先建成国家高水平科技智库,率先建设国际一流科研机构。

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武汉病毒所构建全球虫媒病毒与节肢动物特异性病毒综合信息数据集

2023-05-23 武汉病毒研究所
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吸血节肢动物中传播循环的病毒有两大类,即虫媒病毒(arbovirus)和节肢动物特异性病毒(arthropod-specific virus,ASV)。虫媒病毒能在脊椎动物和节肢动物中复制,对人类或动物具有致病性,给全球公共卫生造成负担。节肢动物特异性病毒仅在节肢动物中复制,可能是虫化病毒进化的起源。然而,目前没有涵盖所有已知虫媒病毒和节肢动物特异病毒种类、生物安全风险等级、基因组节段、地理分布等信息的综合数据集。

5月19日,《科学数据》(Scientific Data)在线发表了中国科学院武汉病毒研究所/生物安全大科学中心袁志明/夏菡团队在虫媒病毒生态健康和生物安全领域的最新研究成果(《全球虫媒病毒和节肢动物特异病毒的序列、多样性及生物安全风险综合数据集》,A global dataset of sequence, diversity and biosafety recommendation of arbovirus and arthropod-specific virus)。该研究通过整合美国CDC虫媒病毒名录(Arbovirus Catalog)、第六版《微生物和生物医学实验室生物安全》(BMBL 6th)附录VIII-F、国际病毒分类委员会(ICTV)的病毒分类信息以及Genbank序列等相关信息,提取分类学、生物安全风险、基因节段、核酸和氨基酸序列、地理分布等信息,构建了首个全球虫媒病毒和节肢动物特异病毒的综合数据集。

该数据集包含615个虫媒病毒(460个病毒种)、98,994条记录和190个节肢动物特异病毒(180个病毒种)、2,100条记录,涉及34个病毒科、89个病毒属和640个病毒种(图1a)。该成果展示了虫媒病毒和节肢动物特异病毒间的基因组节段差异(图1b)、生物安全风险建议等级(图1c)、病毒及其节肢动物媒介的全球分布、宿主来源等特征(图1d)。为剖析虫媒病毒和节肢动物特异病毒的相互作用、进化规律和风险评估提供了丰富的数据资源(图2)。

该研究由武汉病毒所和浙江大学合作完成。研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金和中国科学院中-非联合研究中心等的支持。

论文链接

数据链接

图1. 虫媒病毒和节肢动物特异病毒的分类、基因组节段和生物安全分级建议和宿主来源

图2. figshare数据集部分信息

打印 责任编辑:侯茜

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