语音播报
《细胞》
冷冻电镜揭示细菌外膜蛋白折叠多个阶段
美国国立卫生研究院Harris D. Bernstein、Jenny E. Hinshaw等研究人员合作揭示了细菌外膜蛋白折叠的多个阶段。该项研究成果日前在线发表于《细胞》。
研究人员表示,跨膜的β桶蛋白通过β桶装配机器(BAM)折叠到革兰氏阴性细菌的外膜(OM)中,这个过程不为人所知,而且发生时没有已知的外部能量来源。
通过使用单粒子冷冻电镜,研究人员观察了BAM对一个模型β桶蛋白(EspP)的折叠动态。结果发现,BAM与EspP高度保守的“β信号”模体结合,在折叠过程中正确引导OM中的β链。研究人员还发现,EspP的折叠是通过“杂交桶”中间物进行的,其中膜整合的β片被连接到重要的BAM亚单位BamA上。这些结构显示了EspP中间产物周围的膜出现了前所未有的偏转,并表明β片逐渐向BamA折叠,形成一个β桶。随着体内实验在改变OM张力的同时跟踪β桶的折叠,这些结果支持一个模型,即BAM利用OM的弹性来加速β桶的折叠。
相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.02.016
空间CRISPR基因组学研究肿瘤微环境调节因子
美国西奈山伊坎医学院Brian D. Brown研究小组利用空间CRISPR基因组学揭示了肿瘤微环境的调节因子。日前《细胞》在线发表了这项成果。
研究人员开发了一种叫做Perturb-map的空间功能基因组学方法。研究人员应用Perturb-map在一个肺癌小鼠模型中平行敲除了数十个基因,并同时评估了每个敲除基因如何影响肿瘤生长、组织病理学和免疫组成。此外,研究人员将Perturb-map和空间转录组学匹配,对CRISPR编辑过的肿瘤进行无偏倚的分析。结果发现,在Tgfbr2基因敲除的肿瘤中,肿瘤微环境(TME)被转化为纤维黏液状态,T细胞被排除在外,同时出现TGFβ的上调以及TGFβ介导的成纤维细胞激活,这表明癌细胞上TGFβ受体的丧失增加了TGFβ的生物利用率及其对TME的免疫抑制作用。
这些研究表明,Perturb-map在组织内能以单细胞分辨率进行功能基因组学研究,而且保留了空间结构,并提供了关于癌细胞的TGFβ反应性如何影响TME的认知。
相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.02.015
《自然—生物技术》
可编程封装系统改善治疗性细菌在小鼠体内输送情况
美国哥伦比亚大学Tal Danino、Kam W. Leong等研究人员合作开发出一个可编程的封装系统,能够改善治疗性细菌在小鼠体内的输送情况。相关论文日前在线发表于《自然—生物技术》。
研究人员开发了一个基因编码的微生物封装系统,该系统具有可调控和动态表达的表面囊状多糖,可增强全身性的传递。基于胶囊生物合成途径的小RNA筛选,研究人员构建了可诱导的合成基因回路,可调节大肠杆菌Nissle 1917中的细菌封装。这些细菌能暂时躲避免疫攻击,而随后失去封装则会导致体内的有效清除。这种动态传递策略使细菌的最大耐受剂量增加了10倍,并提高了小鼠癌症模型的抗肿瘤效果。
此外,原位封装增加了微生物在小鼠肿瘤中的转位,从而产生远端肿瘤的疗效。可编程封装系统有望提高活体工程细菌对癌症的治疗效用。
相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41587-022-01244-y
空气污染严重地区的新生儿体重更易偏低
据新华社电 以色列一项新研究发现,出生在空气污染严重地区的新生儿体重过轻的风险会增加25%。相关论文近日发表在美国《环境研究》期刊上。
以色列希伯来大学等机构研究人员分析了2004年至2015年间近22.4万名该国产妇及其生育的超过38.1万名新生儿的数据,同时参考了内盖夫本—古里安大学卫星数据提供的单日每平方公里空气污染物浓度信息。
研究发现,孕妇暴露于空气污染环境下与新生儿体重不足之间存在明显关联,出生在空气污染严重地区的新生儿体重过轻的风险会增加25%。
研究团队成员、希伯来大学流行病学家哈盖·莱文对当地媒体表示,这一研究较为罕见地评估了空气污染对胎儿的影响。许多与空气污染相关的健康问题需要很长时间才能显现,但与新生儿体重之间的关联能很快被对比发现。
莱文介绍,出生体重偏低是成年后潜在健康问题的重要指标,政策制定者应在更大范围内展开相关研究,在生命初期对健康给予足够重视。
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