《细胞》
　　研究发现多种神经退行性疾病的同型纤维形成
　　美国哥伦比亚大学Anthony W.P. Fitzpatrick等研究人员合作发现TMEM106B在多种神经退行性疾病中的同型纤维形成。相关论文3月4日在线发表于《细胞》。
　　研究人员发现，由TMEM106B的135个氨基酸的C端片段组成的淀粉样纤维是不同人类神经退行性疾病的共同发现，包括以TDP-43、tau或α-synuclein蛋白的异常聚集为特征的病例。冷冻电子显微镜和质谱分析相结合，解析了TMEM106B纤维的结构问题，其分辨率为2.7埃，这些样品来自患有TDP-43病理的额颞叶变性（FTLD-TDP，n=8）、进行性核上麻痹（PSP，n=2）或路易体痴呆（DLB，n=1）的死后人类大脑组织。由TMEM106B（一种溶酶体/内体蛋白）组成的丰富淀粉样纤维与广泛使人衰弱的疾病的共性提示了一个共同的纤维形成途径，可能会启动或加速神经退化。
　　相关论文信息：https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.02.026
　　《自然—方法学》
　　半胱氨酸反应性磷酸化依赖性变化的全局分析
　　美国斯克里普斯研究所 Benjamin F. Cravatt和Esther K. Kemper共同合作取得重要进展。他们开发了一种化学蛋白质组学方法，能够整体分析半胱氨酸反应性中磷酸化依赖性的变化。该项研究成果近日在线发表于《自然—方法学》。
　　研究人员描述了一种化学蛋白质组学方法，将丝氨酸/苏氨酸磷酸化与半胱氨酸残基的反应性变化定量地联系起来，这个参数可以影响半胱氨酸被翻译后修饰或被共价药物作用的潜力。利用在有丝分裂细胞中发生的广泛的高化学计量的磷酸化，研究人员发现了许多半胱氨酸，这些半胱氨酸对富含细胞周期调节途径的不同蛋白质的反应性表现出磷酸化依赖的反应性变化。发现半胱氨酸反应性的双向变化往往发生在丝氨酸/苏氨酸磷酸化事件的附近，这表明磷酸化对蛋白质的化学反应性有广泛的影响，未来有可能创造出小分子探针，以不同的PTMs为目标靶向蛋白。本文描述了一种化学蛋白质组学方法，可将丝氨酸/苏氨酸磷酸化与半胱氨酸残基反应性的变化定量联系起来，从而影响它们被翻译后修饰或被亲电子小分子靶向的潜力。
　　相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41592-022-01398-2
　　《自然—神经科学》
　　人类语言处理的共享计算原则
　　美国普林斯顿大学Ariel Goldstein研究组的最新研究揭示了人类语言处理的共享计算原则和深度语言模型（DLM）。相关论文3月7日发表于《自然—神经科学》。
　　9名参与者收听了一个30分钟的播客，同时使用皮层脑电图（ECoG）记录了他们的大脑反应。他们提供的经验证据表明，人脑和自回归DLM在处理相同的自然叙述时共享3个基本计算原则：二者都在词开始之前进行连续的下一个词预测；二者都将他们的发病前预测与传入的词相匹配，以计算发病后的惊喜；二者都依赖于环境嵌入来表示自然环境的语言。
　　总之，研究结果表明，自回归 DLM 为研究语言的神经基础提供了一个新的生物学上可行的计算框架。
　　研究人员表示，与传统语言模型不同，深度学习的进步催生了一种新型的预测（自回归）DLM。使用自我监督的下一个词预测任务，这些模型在给定的上下文中生成适当的语言反应。
　　相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41593-022-01026-4
　　《英国医学杂志》
　　肾功能衰竭患者接受肾移植可显著降低死亡风险
　　近日，英国伯明翰大学Adnan Sharif团队对接受移植与等待移植的肾衰竭患者存活率进行了荟萃分析。相关论文发表于《英国医学杂志》。
　　研究组在MEDLINE、科学引文索引等大型数据库中检索从建库至2021年3月1日的临床试验，筛选出所有针对等待移植手术的肾衰竭患者，评估移植和透析全因死亡率的比较研究。由两名独立评审员提取数据，并评估纳入研究的偏倚风险。荟萃分析使用DerSimonian-Laird随机效应模型，异质性通过亚组分析、敏感性分析和荟萃回归进行调查。
　　该研究共确定了无随机对照试验的48项观察性研究，涉及1245850名患者。总体来说，与透析相比，92%的研究报告了与移植相关的长期（至少一年）生存益处。然而，其中有11项研究发现，与继续透析相比，移植在统计学上没有显著益处。在18项适用于荟萃分析的研究中，肾移植显示了生存益处（风险比为0.45），即使在亚组/敏感性分析或荟萃回归分析后仍存在显著的异质性。
　　研究结果表明，对于大多数肾衰竭患者来说，肾移植仍然是降低全因死亡率的最佳治疗方式，但某些亚组可能缺乏生存益处。鉴于供体器官持续短缺，需要进一步的证据来更好地为肾衰竭患者的决策提供信息。
　　相关论文信息：https://doi.org/10.1136/bmj-2021-068769