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“小柯”秀

2022-03-01 中国科学报
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  《细胞》

  转录因子蛋白质相互作用组揭示心脏病遗传决定因素

  美国格莱斯顿研究所Deepak Srivastava、Katherine S. Pollard等研究人员合作利用转录因子蛋白质相互作用组揭示心脏病的遗传决定因素。相关论文近日在线发表于《细胞》。

  研究人员假设,先天性心脏病(CHD)的遗传决定因素可能在于转录因子的蛋白质相互作用组,这些转录因子的突变会导致CHD。研究人员在人类心脏祖细胞中定义了两个转录因子(GATA4和TBX5)的相互作用组,并将结果与近9000个来自亲属三人组的外显子进行整合,发现与CHD相关的新发错义变体在相互作用组中富集。根据残基、基因和渊源特征对交互组成员的变体进行评分,研究人员确定了可能的CHD致病基因,包括表观遗传阅读器GLYR1。

  GLYR1和GATA4广泛地共同占据并共同激活心脏发育基因,所确定的GLYR1错义变体破坏了与GATA4的相互作用,损害了小鼠的体外和体内功能。这种综合的蛋白质组学和遗传学方法提供了一个框架,可用于确定心脏疾病中遗传变异体的优先次序并进行研究。

  相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.01.021

  《免疫》

  研究揭示传统树突状细胞和浆细胞样树突状细胞共同起源

  美国纽约大学Boris Reizis、Jue Feng等研究人员合作揭示传统树突状细胞和浆细胞样树突状细胞的共同起源。相关论文近日在线发表于《免疫》。

  研究人员表示,树突状细胞(DC)包括传统DC(cDC,包括cDC1和cDC2亚群)和浆细胞样DC(pDC),其发育起源一直不清楚。

  通过使用诱导性系谱追踪结合克隆DNA“条形码”、单细胞转录组和表型分析(CITE-seq),研究人员报道了成年小鼠的DC发育。对骨髓中Cx3cr1+造血祖细胞的诱导追踪显示,它们同时产生所有的DC亚群,包括pDC、cDC1和cDC2。造血干细胞(HSC)和Cx3cr1+祖细胞的克隆追踪显示,cDC1和pDC之间有克隆共享,但两个cDC亚群之间或pDC和B细胞之间没有。因此,对分化的造血干细胞和Cx3cr1+祖细胞的CITE-seq分析确定了pDC发育的渐进阶段,包括不同于淋巴祖细胞的Cx3cr1+Ly-6D+pro-pDC。

  相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.immuni.2022.01.016

打印 责任编辑:侯茜
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