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“小柯”秀

2021-08-16 中国科学报
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  《自然》

  研究发现H2A.Z置入不足与子宫肌瘤发生有关

  芬兰赫尔辛基大学Lauri A. Aaltonen、Eevi Kaasinen等研究人员合作发现,H2A.Z置入的不足与子宫肌瘤(UL)的发生有关。研究成果近日在线发表于《自然》。

  研究人员创建了全基因组数据集,通过使用DNA、RNA、转座酶可及染色质检测(ATAC)、染色质免疫沉淀(ChIP)和HiC染色质免疫沉淀(HiChIP)对原始组织进行测序,揭示了UL的成因。

  研究人员确定了编码SRCAP组蛋白装载复合物6个成员基因的体细胞突变,并发现SRCAP成员YEATS4和ZNHIT1的生殖系突变使妇女容易患UL。在UL中,H2A.Z的占据率与染色质可及性和基因表达呈正相关,与DNA甲基化呈负相关,但在带有SRCAP复合体突变的肿瘤中这些相关性较弱。在这些肿瘤中,在H2A.Z丢失的转录起始位点出现了开放的染色质,这与基因的上调有关。此外,YEATS4的缺陷与二价胚胎干细胞基因的异常上调有关,正如以前在小鼠中显示的那样。

  这项工作描述了一种潜在的肿瘤发生机制:由H2A.Z置入不足引起的表观遗传不稳定,并表明UL是通过染色质紊乱驱动的异常分化程序产生的,该程序由少数相互排斥的驱动突变产生。

  相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41586-021-03747-1

  《美国化学会志》

  科学家用机器学习辅助非规范DNA折叠基序

  美国加利福尼亚大学河滨分校Wenwan Zhong团队通过阵列主客体传感系统机器学习辅助非规范DNA折叠基序的分类和识别。相关研究成果近日发表于《美国化学会志》。

  阵列式主客体荧光传感器系统可以利用选择性分子识别来区分和分类多种不同的非常规DNA结构。该传感器具有高度选择性,能够区分与天然G—四链体类似的褶皱和具有凸起或空位的褶皱。宿主和客体可以与DNA链形成杂三元复合物,宿主作为DNA和染料之间的媒介,调节发射。

  通过将机器学习算法应用于传感数据,可以高保真地预测未知DNA链的折叠状态。

  相关论文信息:https://doi.org/10.1021/jacs.1c06031

  《英国医学杂志》

  低血糖饮食有助于改善糖尿病患者血糖控制

  加拿大多伦多大学John L Sievenpiper团队研究了低血糖指数(GI)/负荷(GL)饮食模式对糖尿病患者血糖控制和心脏代谢危险因素的影响。相关论文近日发表于《英国医学杂志》。

  研究组在Medline、Embase和Cochrane数据库中检索从建库至2021年5月13日间关于研究低GI/GL饮食对糖尿病的影响,且为期3周及以上的随机对照试验,并进行系统回顾和荟萃分析。主要结局为糖化血红蛋白(HbA1c)。

  研究组共纳入29项试验,涉及1617名接受高血糖药物或胰岛素治疗的1型和2型糖尿病患者。这些患者多为中度、超重或肥胖,且中度控制2型糖尿病。与高GI/GL对照饮食相比,低GI/GL饮食模式显著降低了HbA1c。空腹血糖、低密度脂蛋白胆固醇、非高密度脂蛋白胆固醇、载脂蛋白B、甘油三酯、体重、体重指数和C反应蛋白也显著降低,但血胰岛素、高密度脂蛋白胆固醇、腰围或血压没有降低。GL和HbA1c以及膳食绝对GI和收缩压的差异呈正剂量—效应梯度。HbA1c降低的证据确定性高,大多数次要结局的证据确定性中等,降低主要是由于不精确。

  综合结果表明,除高血糖药物或胰岛素同时治疗外,低GI/GL饮食模式对血糖控制、血脂、肥胖和炎症的既定目标有微小显著改善,这主要发生在中度控制的1型和2型糖尿病成人中。

  相关论文信息:https://doi.org/10.1136/bmj.n1651

打印 责任编辑:阎芳

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