图为印尼群岛东西部人群的遗传扩散历史。云南省文物考古研究所 供图

据云南省文物考古研究所消息，由中国科学院昆明动物研究所、厦门大学、复旦大学、云南省文物考古研究所、云南民族大学和印度尼西亚国家研究与创新署史前考古中心等团队合作完成的一项研究，首次以印尼西部高质量古基因组证据，重建了著名生物地理分界线“华莱士线”东西两侧古人群的遗传分化历史。相关论文已在Cell Press旗下综合期刊iScience在线发表。

印度尼西亚岛屿众多，地处亚洲大陆与大洋洲之间，华莱士线将其分为东西两部分，两侧在文化与遗传上差异显著。受热带高温高湿环境制约，古代DNA保存极为困难，印尼西部长期缺乏高质量古基因组数据。

研究团队对苏门答腊岛北部Loyang Mendale洞穴出土的古人类遗骸进行深度测序，采用单链文库构建和靶向捕获技术，并通过DNA末端损伤模式、污染率评估等方式严格验证真实性，获得距今约3300年和1700年的两例古基因组。这是目前华莱士线西部最早的人群古基因组数据。结合东南亚岛屿地区已发表的距今约7000至200年的古基因组，研究系统重建了印尼群岛东西部的人群遗传历史。

样本的祖源构成为南岛语族人群成分43.3%、和平文化人群相关成分29.1%、东南亚大陆新石器晚期至青铜时代人群相关成分27.6%。这一比例与Loyang Mendale遗址叠压的文化层序列——从和平文化石器，到早期南岛语族风格陶器，再到大陆东南亚文化因素逐层对应，说明文化变迁背后伴随真实的人群迁徙与融合。

基于新数据与已发表古基因组、现代人群数据的综合分析，研究提出印尼东西部遗传差异形成的“两阶段”模型。第一阶段在全新世早期或更早，印尼东西部已存在显著遗传差异，西部采集狩猎人群可能与大陆东南亚和平文化人群亲缘更近，东部以巴布亚相关祖源为基础，与华莱士线的地理隔离高度契合。第二阶段自距今约四五千年开始，南岛语族人群扩张为全境带来早期南岛语族遗传成分，但并未简单替代原有深层祖源成分；此后西部多次接受大陆东南亚基因流，东部则经历巴布亚相关人群回流，最终形成现代印尼人群“深层分化、多层叠加、区域延续”的格局。

研究表明，华莱士线不仅是经典生物地理分界线，也是理解海岛东南亚史前人群分化的重要地理屏障，为研究南岛语族起源与扩散海岛东南亚跨岛迁徙网络以及全球海岛人群多样性形成机制提供了新证据。