被考古学界誉为“石破天惊”的新石器时代石峁遗址，是中国目前所知规模最大的史前城址，其复杂的城防布局、多元的祭祀遗迹与高等级的文物遗存，展现出典型的早期国家形态与高度的社会复杂化特征。

然而，对于4000多年前的石峁遗址人群来源、社会结构及与周边人群的关系等科学问题，学界长期以来颇有争议，也备受关注。

来自中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(古脊椎所)的最新消息说，该所付巧妹研究团队联合陕西省考古研究院/西北大学孙周勇考古团队，并与首都师范大学、中国社会科学院等机构的合作者一起，对来自石峁遗址及周边、晋南地区遗址共169例古代人骨样本，历时13年展开大规模、高分辨率、系统性古DNA研究，终于以确凿的遗传学证据破解石峁遗址人群来源、社会结构、周边关系等谜题。

这项石峁遗址考古取得的重大研究突破，是全球范围内首次从遗传学角度对如此大规模、高复杂性的史前都邑性遗址进行社会制度和组织结构研究，也是首次用古DNA重建中国最大规模、具清晰早期国家特征的史前城址的复杂社会组织结构及与亲缘绑定的森严等级制度。北京时间11月27日凌晨，相关成果论文以“石峁古城古DNA揭秘新石器时代中国地区亲缘关系习俗”为题在国际知名学术期刊《自然》上线发表。

论文通讯作者付巧妹研究员指出，本项研究以确凿遗传学证据，证实石峁文化人群主体源于陕北仰韶晚期人群，确立其文化和人群发展的连续性；揭示石峁文化人群与周边陶寺文化人群、北方草原文化人群、南方稻作农业人群之间存在着密切关联，展现出史前农牧业人群广泛的互动交流历史场景；精细重建石峁古城内部横跨四代的家族谱系，清晰透视其以父系亲缘为核心构建社会等级的运行模式，为理解中国早期国家的形成发展过程提供前所未有的社会组织范本，为探究东亚早期国家起源的权力继承模式、统治家族与社会阶层构成提供首个直接的遗传学证据。