北京时间9月25日，国际学术期刊《细胞》（Cell）在线发表新疆小河墓地出土的“最古老奶酪”系统性古微生物基因组研究成果，该研究成果由中国科学院大学人文学院考古学与人类学系杨益民教授和中国科学院古脊椎动物与古人类研究所付巧妹研究团队、新疆文物考古研究所、新疆大学、国家文物局考古研究中心、北京大学第三医院等单位合作完成，论文共同第一作者刘逸宸、付巧妹，共同通讯作者付巧妹、杨益民。

该研究被《细胞》选为重点推荐论文，是国际首个古代奶制品遗存宏基因组研究。从距今约3500年的3例古老奶酪样本中提取出较高质量的开菲尔乳酸菌基因组，发现其形成不同于欧洲菌株的分支，揭示开菲尔乳酸菌的另一独立的东亚内陆传播路线；且通过探索开菲尔乳酸菌适应性演化历程，厘清新疆塔里木盆地古人群的生活方式，技术文化的交流和发展，以及在进化时间尺度上开菲尔乳酸菌与人群协同演化、互利共生的分子机制。

食品发酵是人类历史上最古老的利用微生物进行生产实践的行为，不同族群文化对食品发酵有各自的偏好，生业模式的转变及农业发展也和发酵技术的演变息息相关。发酵奶制品很可能是最早出现的发酵食品，尽管人类食用发酵奶制品的历史悠久，但目前关于人类历史上对发酵微生物的应用和技术交流历史，以及发酵微生物本身的演化过程，特别是发酵微生物在长时间驯化条件下功能性基因的演变人们知之甚少。

此项研究通过重建其发酵微生物群落，进一步确证该奶酪制品由开菲尔乳酸菌发酵生产，而且用于制作开菲尔奶酪的产奶山羊来自新石器时代之后广泛分布在欧亚大陆的一个支系，而非东亚内陆地区同时期分布的驯化山羊。该结果表明新疆塔里木盆地古人群对开菲尔酸奶的开发很可能与该时期和欧亚草原人群的交流有关。

该研究通过对新疆古代开菲尔乳酸菌的系统发育关系分析，揭示了开菲尔乳酸菌的一条新的传播路线。研究发现用于发酵的开菲尔乳酸菌分两个重要支系，一个支系主要包括来自欧洲、亚洲沿海和岛屿地区的菌株，另一支系主要包括分布在东亚内陆地区的菌株。研究发现，开菲尔乳酸菌两个支系的分化，很可能就是其共同祖先最初被驯化后在不同人群的传播所导致的，代表不同古人群在应用和驯化发酵微生物过程中发生了不同路线的迁徙与交流。

（原载于《中国青年报》 2024-10-07 03版）