近日，中国科学院杭州医学研究所组学与智慧医疗中心联合瑞典乌普萨拉大学、华大生命科学研究院、华大基因智惠医学研究院在《自然》发表论文，公布了全球最大规模的结直肠癌多组学研究结果，并结合临床信息系统总结了与临床结果和疾病进展密切相关的分子特征。结直肠癌被称为“沉默杀手”，全球每年结直肠癌新增病例约190万例，发病率居所有癌症第三位。针对瑞典知名癌症样本与数据库U-CAN队列中的1063例结直肠癌样本，中瑞两国科研团队进行了全基因组和转录组测序分析，鉴定96个显著突变基因，其中24个为新发现的潜在驱动基因，并发现与WNT、EGFR和TGF-β通路相关的驱动基因和结直肠癌生存显著相关。研究人员利用突变时序分析，推导出9个与癌症发生早期事件相关的驱动突变基因和更倾向于在癌症发生后期阶段出现的突变基因。这些发现为结直肠癌的早期检测和靶向治疗提供了临床研究策略，并揭示了与肿瘤后期侵袭和转移相关的重要分子变化。此前，已有不少研究对结直肠癌相关的编码区突变作了较为详尽的解析，然而，这些研究主要集中在外显子区域测序、寻踪编码区的突变，对全基因组范围内非编码区致病突变的探索有所忽略。在该研究中，研究人员利用高深度全基因组测序优势，在线粒体基因组和非编码区域中也发现了与疾病相关的突变，并对其中与疾病进展显著相关的突变进行了系统性总结。研究团队基于肿瘤基因表达差异，将结直肠癌预后分为5个预后表达谱精细分型（CRPS）亚型。研究人员表示，相较于结直肠癌经典的共识分子分型，该研究构建的CRPS系统能更加准确地预测预后。研究结果提示，整合基因组和转录组数据的分子分型能得到更精细准确的患者预后分层，这对优化临床肿瘤分型、指导结直肠癌精准治疗具有重要意义，新构建的表达谱精细分型将在未来指导结直肠癌个体化诊疗中发挥重要作用。相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41586-024-07769-3（原载于《中国科学报》 2024-08-15 第1版 要闻）