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【中国科学报】中科院成都生物所等绘制全球首个青稞基因组图谱

2015-01-20 中国科学报 彭科峰
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  近日,中科院成都生物研究所与西藏农牧科学院、华大基因共同绘制了全球首个青稞基因组草图。相关成果发布在《美国国家科学院院刊》上。

  青稞是青藏高原地区农牧民的主要食粮和牲畜饲料。在青藏高原长期的自然选择和人工驯化下,形成了对高原复杂地理、气候环境良好的适应性,是作物改良的重要遗传资源。

  科研人员利用基因组鸟枪法,对青稞地方品种“拉萨钩芒”进行了深度测序,发现青稞基因组大小为4.5Gb左右,其中80%以上为重复序列。组装获得约3.89Gb基因组序列,占整个基因组的87%。该研究预测出编码蛋白基因并将其中94%的基因锚定到7条染色体上。

  科研人员将青稞与六倍体普通小麦、二倍体节节麦、乌拉尔图小麦、水稻、高粱、玉米等禾本科重要粮食作物(或其祖先种)进行了深入的比较分析,构建了系统进化树,分析了基因组复制、共线性关系以及基因家族的扩张等基因组进化特征。

  通过与非高原大麦基因组序列进行比较发现,青藏高原野生大麦与该地区栽培品种亲缘关系更近,进一步证实西藏是栽培大麦的驯化中心之一。此外,高原大麦基因组中植物激素信号转导、植物与病原物互作、次生代谢合成等大量与环境胁迫适应性相关的基因受到显著选择,这可能是青稞适应高原环境胁迫的重要原因。

  (原载于《中国科学报》 2015-01-20 第4版 综合)

打印 责任编辑:侯茜

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