86. 生物起源与进化生物学研究

以比较基因组学和功能基因研究为核心，探索了物种演化的分子机制和人类起源的遗传学机制，开展了进化、适应、生态特征有关的进化或协同进化研究，获得了一批重要的成果。采集了覆盖整个东亚、中亚地区和中西伯利亚，标本量为全球同类研究最大规模的12127个男性血样，应用世界上最先进的Y染色体单倍型研究手段，为东亚现代人群起源于非洲提供了遗传学方面的最新证据。通过对“猴王基因”家族的研究，发现通过基因分裂能产生新的基因，并第一次阐明了基因分裂是如何实现的，证明了基因演化不总是由简单到复杂，也可以由复杂到简单。在世界上首次系统描述并命名了一个新的植物繁育系统——花柱反卷性，对研究被子植物繁育系统的进化具有重要的科学意义。与瑞典科学家合作，通过研究狗线粒体DNA的分子钟，系统研究了来自欧洲、亚洲、非洲和北美地区约590只狗和欧亚大陆狼的遗传变异，计算出狗线粒体DNA形成的时间应在15000年前，证明了狗起源于东亚。

87. R值精确测量与τ粲物理研究

高能物理研究所北京谱仪国际合作组于1999年完成的2～5GeV能区R值精确测量工作，测量精度比此前的国际平均值提高了2至3倍，2～5GeV能区R值的实验技术、加速器技术和测量结果都处于世界领先地位，被国际高能物理界公认为近年来重要研究成果之一。该成果被评为2002年度科学院重大创新贡献奖，并获2003年度北京市科学技术奖一等奖。

该结果对精确检验标准模型理论、提高对Higgs粒子质量拟合的精度从而寻找Higgs粒子和发现新物质有重大影响。2003年，发现了在质子—反质子质量阈的显著的奇异增长结构，可能是一个新型多夸克态粒子，再次引起国际高能物理界的广泛关注，著名理论物理学家J.Ellis和J.Brodsky分别在有关评述文章和国际会议报告中称最近这些新发现“令人惊异”，“对发展强相互作用理论有着重要意义”。

88. 超重新核素的合成与研究

近代物理研究所在兰州重离子加速器(HIRFL)上开展了对超重核素的研究，在我国新核素合成领域取得了从无到有、从合成几个到合成一大片的重大进展。率先在重质量丰中子区首次合成和研究了9种新核素，占同期国际上合成新核素的2/3。成功地在超重区合成了新核素259Db，获得了国内外同行的高度评价和广泛关注，实验中所得到的结果很快被国外编纂的核素图采用。该成果被评为2001年我国基础研究的十大进展之一。

89. 理论生物物理与生物信息学研究

理论物理研究所在与生命科学交叉的理论物理研究方面取得了国际影响的成果。如，针对单分子DNA力学问题，引入碱基相互作用，提出了一个双链DNA弹性理论，在全力程范围解释DNA拉伸试验，计算肿瘤抑制蛋白P53识别序列Waf1的弹性模量只是通常DNA的三分之一，表明柔软性是P53捆绑变异位点阻止致癌染色体分裂的物理机制。该工作在21届IUPAP国际统计物理大会上作30分钟大会邀请报告，被邀在《理论与计算纳米技术手册》(美国科学出版社，2004)撰写长篇综述“DNA分子理论计算”。撰写了我国第一本《生物信息学手册》，提出的基因组序列短串可视化方法被美国国家标准和技术署、欧洲生物信息学研究所命名为“郝”直方图。此外，郝柏林、郑伟谋等独立发展了完全自主基因组序列注释软件BGF，已用于我国水稻基因组计划及家蚕基因组研究。

90. 热核聚变实验研究

合肥物质科学研究院在HT-7超导托卡马克装置运行与物理实验研究方面获多项原创性成果。高约束等离子体存在时间为220倍能量约束时间，继续保持国际领先；HT-7成为世界上第二个超过分钟级高温等离子体放电的托卡马克装置，最高电子温度超过5000万度，在国际同等规模装置中处于领先地位。在2004年4月11日至6月14日进行的高温等离子体物理实验研究中，放电脉冲长度突破了百秒关，达到了240秒，取得了突破性进展。