编者按 中国科学院知识创新工程试点工作已进入第七个年头，对于这项党中央、国务院给予了巨大支持，社会各界给予了巨大关注的事业，经播种、培育，已到了初步开花、结果的时候。本刊将以“改革、创新、发展”为题，分三期向国家，向公众，特别是向科技界汇报我院试点工作的进展和取得的成果，希望能得到社会各界更多的理解和支持，并促成我国知识创新工程的全面开展和国家创新体系的最终形成。

一 知识创新工程试点概况

1997年，中国科学院在对国际、国内经济社会和科技发展趋势进行战略研究的基础上，向中央提出了《迎接知识经济时代，建设国家创新体系》的研究报告，该报告系统分析了世界知识经济发展态势及其对我国的挑战，提出了建设面向21世纪的我国国家创新体系的思路与新时期中国科学院的战略选择，并建议国家组织实施“知识创新工程”。

1998年2月4日，江泽民同志在报告上做了重要批示：“知识经济、创新意识对于我们21世纪的发展至关重要。科学院提出了一些设想，又有一支队伍，我认为可以支持他们搞些试点，先走一步。真正搞出我们自己的创新体系”。1998年6月9日，国家科技教育领导小组第一次会议，审议并原则通过了中国科学院《关于“知识创新工程”试点的汇报提纲》，决定中国科学院知识创新工程试点工作分三个阶段实施，1998-2000年为启动阶段，2001-2005年为全面推进阶段， 2006-2010年为优化完善阶段。从此，中国科学院掀起了一场波澜壮阔的科技体制改革和科技创新的浪潮。

(一)知识创新工程试点总体进展

实施知识创新工程试点以来，在党中央国务院的领导和关怀下，在全国科技界和有关部门的大力支持下，我院广大职工锐意改革，开拓创新，试点工作进展顺利，全院发展态势良好。总体上看，我院正处在历史上最好的发展时期之一，整体发展比我们预想的要好，创新能力提升比我们预想的要快，大部分研究所已具备了持续发展的条件，部分研究所和一些重要领域已具备了创新跨越的可能。

1凝练科技目标，调整科技布局结构

在知识创新工程启动阶段，我院按照统一规划、分步实施、重点突破的原则，于1998年率先启动了大连化学物理研究所、理论物理研究所和南京地质古生物研究所三种不同类型研究所为单元的试点工作。通过所际整合等改革，组建了上海生命科学研究院、数学与系统科学研究院、国家天文台等一批综合性大型科技创新基地，并相继启动了创新基地内有关研究所的试点工作，同时要求其它各研究所按试点标准积极进行改革。

进入全面推进阶段以来，我院进一步深化科技布局结构调整。在若干新兴交叉领域新建了一些法人研究机构，与地方和大学共建了若干研究发展机构，加大了对现有研究所发展方向的调整力度，整合了一批研究所，完成了13家事业单位企业化转制。此外，我院还在交叉新兴学科方向新建了一批非法人研究机构，建立了7个区域性技术转移中心。

进一步加强了全院的科技规划，按照从国家战略需求和世界科技发展趋势出发确定重点领域和组织重大任务的思路，并按重大项目、重要方向性项目和领域前沿项目三个层面进行了部署。

2改革管理体制，建立现代院所制度

我院以人事制度改革为重点带动整体改革，在全国率先进行了以“按需设岗、按岗聘任、择优上岗、动态更新”为主要内容的岗位聘任制，建立了体现绩效优先原则的“基本工资、岗位津贴、绩效奖励”三元结构分配制度。

以资源配置制度改革带动管理创新，明确了“整体规划、保证重点、择优支持、鼓励竞争、优化配置、动态调整”的资源配置方针；按照“质重于量、分类评价、公开公正、科学严肃”的原则，建立了研究所评价体系，并建立了基于评价结果的资源配置调整机制，奖优罚劣。

坚持“依法办院”，进一步规范实行了所长负责制、研究所党委工作制度和职工代表大会制度，强化了研究所的整体调控和组织能力。

3明确战略定位，确立新时期办院方针

2002年，我院按照“既要保持一定的历史连续性，更要把握时代特点，与时俱进，面向未来”的思路，提出了新时期的办院方针，即：“面向国家战略需求，面向世界科学前沿，加强原始科学创新，加强关键技术创新与系统集成，攀登世界科技高峰，为我国经济建设、国家安全和社会可持续发展不断做出基础性、战略性、前瞻性的重大创新贡献”。

新办院方针继承了我院历次办院方针的共同特点，将为国家需求服务与科学技术发展有机结合，同时也充分反映了我国实现第三步发展目标对科学技术新的需求和我院在国家创新体系中的战略定位。

4规划长远蓝图，实施新时期发展战略

2000年，我院在试点二期报告中，提出了到2010年的发展蓝图。一是拥有80个左右具有强大科技创新和持续发展能力、特色鲜明的国家研究所，成为我国具有国际先进水平的知识创新和技术创新基地；二是加强院部与学部的结合，充分发挥我院综合优势，成为国家科学思想库；三是拥有与科学研究和高技术发展紧密结合、面向社会、充满生机活力的人才教育培养体系，成为我国培养和造就高级科技创新与创业人才的重要基地；四是形成完善的科技创新成果转化体系与机制，实现科技成果与科技人才不断向社会转移，成为促进我国高技术产业发展的重要基地；五是向全社会普及科学知识、弘扬科学精神、倡导科学方法，成为我国现代科学文明与创新文化的重要源泉和基地；六是进一步扩大开放，积极参与国际科技合作与竞争，共享国际科技资源，成为我国在国际科学界的重要代表。

为了实现上述发展蓝图，我院制定了与之相适应的新时期的发展战略，即：科技创新跨越发展战略、科技创新人才战略和科技创新可持续发展战略。

5知识创新工程试点发展态势

科技布局调整有序推进。较大幅度凝练与提升了科技创新目标，部署了一批新的科技生长点，基本完成了对传统学科布局的结构调整，整体科技布局更加适应我国经济社会发展战略需求和世界科技发展趋势。

体制机制改革取得突破。进行了大力度的用人制度、分配制度、资源配置制度、评价奖励制度和资产管理体制的改革，使创新资源不断向创新能力强、创新效率高的创新单元富集，形成了竞争向上、协同发展的良好局面。

队伍代际转移顺利完成。科技创新队伍明显优化，一批青年学术与管理带头人崭露头角，队伍整体素质和创新能力显著提高，结构日趋合理。研究生教育规模迅速发展，质量进一步提升，初步形成了科研教育紧密结合、相互促进的新局面。

对外竞争能力显著增强。竞争承担国家科技任务总量大幅提升，与地方、企业、大学等的合作不断深入，在国际科学界的地位与影响显著提高。研究所经济状况显著改善，院宏观调控能力有所增强，资金使用效率有所提高。

创新文化建设初见成效。“科学、民主、爱国、奉献”的传统和“两弹一星”精神不断发扬，“唯实、求真、协力、创新”的院风和“依法办院、以德兴院”的理念逐步深入人心，尊重学术自由、追求科学真理、鼓励原始创新、坚持严谨治学、倡导团队协同、崇尚爱国奉献的良好文化氛围正在形成，科技创新环境明显改善，广大科技人员的创新积极性空前高涨，精神面貌焕然一新。

重大创新成果不断涌现。取得了一批事关现代化全局的战略高技术创新成果、一批事关经济社会全面协调可持续发展的重大公益性科技创新成果，在重要基础研究领域取得了一批原始科学创新成果。科技产出数量快速提升，质量也呈现出较快提升的势头。

科技创新产出数量大幅增加。学术论文产出大幅增长。全院SCI论文从1998年的5 860篇上升到2003年的12 060篇，增长106%，其中在各学科领域影响因子居前20位刊物发表论文的数量从1998年的171篇增长至2003年的654篇，增长282%。据中国科技信息研究所最新公布的“中国科技论文统计与分析(2002年)”，发表SCI论文排名前20位的研究机构全部为我院研究所，自1999年以来，各年度前20位也几乎都是我院研究所。

我院发表的高质量论文占全国(不含港澳台地区，下同)比例过半并呈上升态势。1998-2003年，全院在Nature与Science上发表论文数达到119篇，占全国50%以上，从1998年占全国的48%上升到2003年的51%，其中封面文章同比由40%上升到67%；我院在各学科领域影响因子居前20位刊物发表论文达2 491篇，占全国54%，从1998年占全国的44%上升到2003年的53%。

与体量相当的国际一流综合性研究机构德国马普学会(MPG)和法国科研中心(CNRS)相比，我院发表科学论文数增长速度居首，SCI论文总数已超过MPG，从1998年比MPG少1 031篇发展到2003年多4 109篇。我院发表的高水平论文数量与MPG和CNRS的差距迅速缩小，在各学科领域影响因子居前20位刊物发表的论文数从1998年相当于MPG的20%、CNRS的17%，分别上升到2003年的53%和52%。

6年来，我院发明专利、软件著作权登记等知识产权发展迅速。我院发明专利申请与授权量分别由1998年的694项和76项上升到2003年的2 617项和1 055项，分别增长277%和1 288%。我院登记的软件著作权数由1998年的15项，增加到2003年315项，增幅达20倍。

持续发展能力不断增强。6年来，我院经费收入保持了较高的增长速度，从1998年的49.4亿元上升到2003年的97.8亿元，年均增长14.6%，其中对外竞争经费从22亿元上升到44.3亿元，年均增长15.0%。

1998-2003年，我院承担国家“973”项目共113项，占全国的比例达到37%；主持国家基金重大项目共37项，经费总量1.8亿元，分别占全国的50%和46%；主持国家基金重点项目共302项，经费总量3.9亿元，分别占全国的33%和34%。

投入产出效率快速提升。1998-2003年，我院总支出年均增长22%，而同期在各学科领域影响因子居前20位刊物发表论文年均增长速度为31%，发明专利申请量年均增长30%，授权量年均增长69%。

二 科技布局与组织结构调整

知识创新工程试点以来，我院进行了建院以来涉及面最广、意义最为深远的科技布局调整，旨在构建能够支撑与引领我国经济社会全面协调可持续发展和长远未来发展的相对稳定的科技布局。

(一) 优化科技布局

1凝练科技目标

我院将科技目标凝练作为研究所进入知识创新工程试点序列的首要标准，以研究所进入试点序列为抓手，推动研究所进一步凝练科技创新目标，对自身学科布局和重点发展领域进行调整，取得了明显的效果。

瞄准国家战略需求和世界科技发展前沿，部署新的学科生长点，拓宽原有研究领域。例如，大连化学物理研究所部署了生物技术研究，将其列为该所5个主要研究领域之一，确定了药物生物技术、能源与环境生物技术、材料生物技术等重点发展方向。

通过引进领衔人才和优秀团队，调整科技布局，提高科研水平。例如，化学研究所以德国马普高分子研究所、美国国家标准技术局高分子部等国际一流高分子研究机构的学术水平为标准，通过引进国际知名的高分子科学家韩志超为学术带头人，结合国内外优秀青年科研骨干，组建了“聚合物科学与材料研究团队”，开展高分子科学与物理、数学、信息、生命科学、材料科学和环境科学等领域的交叉研究，提出了“力争用10年左右的时间，在某些高分子新材料研究领域达到德国马普高分子研究所的水平，在世界高分子科学和技术领域占有一席之地”的发展目标。

以承担重大项目为牵引，调整组织结构，聚焦领域方向，部署领域前沿。例如，山西煤炭化学研究所以“煤基液体燃料合成浆态床工业化技术开发”和“高性能炭纤维关键技术研究”等重大项目为龙头，形成了3个以科技创新为主体的研究室和5个面向市场的高技术工程研发中心。

通过对传统学科的更新，调整研究所整体方向与定位甚至更名。一批研究所由于科技方向有重大调整相继更名，例如，原上海冶金研究所对学科布局结构进行了较大调整，主要从事信息和能源领域的微系统、器件与材料的研究和开发，也因此更名为上海微系统与信息技术研究所。

2 确定优先领域

为准确把握国家战略需求和科技发展态势，我院组织力量深入进行战略研究，对优先领域进行动态调整，优化选择重点发展领域和方向，形成了《优先发展领域方向和重大项目战略研究》报告，引导各研究所将科技力量向重点领域方向凝聚。

在知识创新工程试点全面推进阶段，推出了科技创新战略行动计划，进一步明确了重点发展信息科技与先进制造、生命科学与技术、物质科学和先进材料、资源环境科学与技术、能源科学与技术、海洋科学与技术、天文与空间科技、数学与系统科学，加强科学技术史及科技政策与发展战略、大科学工程和重大交叉学科前沿研究。对发展迅速的生命科学与生物技术、信息科学与技术、材料科学与技术、能源科学与技术、先进制造与自动化、资源环境科学与技术、空间科学与技术等领域，我院组织实施了科技创新跨越发展战略，进一步提出了在这些领域内有选择地重点支持若干方向，力争实现突破和跨越的目标。

3 部署创新项目

我院按照“领域前沿、重要方向和重大项目”三个层次部署实施了一批创新项目。领域前沿项目着重于探索未知世界、认识自然现象、揭示客观规律，以基础研究和高技术前沿探索为主，原则上由各研究所自主布局、自费支持；重要方向项目主要针对世界科技发展和国家战略需求的重要方向，开展基础性、战略性和前瞻性研究，项目组织注意与国家自然科学基金、“973”、“863”等国家科技计划相衔接；重大项目以解决我国经济发展、国家安全和社会可持续发展的重大战略性科技问题为主要目标，采取顶层设计、统一规划，实现多所多学科系统集成。

到目前为止，我院已部署了88项重大项目和385项重要方向项目，绝大部分项目进展良好，取得了一批重大科技创新成果，产生了显著的经济社会效益。

(二) 调整组织结构

1建设知识创新基地，形成科技创新集群

按照具有明确的战略目标、避免低水平重复布局、鼓励交叉综合，以及具有相对集中的园区和易于共享的支撑条件等原则，我院共建设了18个知识创新基地，形成了在基础科学研究、生命科学与生物技术、资源环境科学研究以及高技术研究与发展等领域，优势较强、规模较大的综合研究基地。

一些创新基地是根据相关研究所战略目标与学科方向基本一致，通过调整与整合能够达到优势互补与综合集成的效果。例如，上海生命科学研究院就是在整合上海地区8个生物学研究所的基础上组建的，其目的是聚焦“人口与健康”领域关键科学技术问题，为13亿人口健康水平的提升做出基础性、战略性、前瞻性重大创新贡献，新机构实行“一级法人、两级管理”的体制。整合后的上海生科院研究实力大为增强，成为我国生命科学与技术领域最重要的研究机构之一。

一些创新基地内研究所间战略目标互补，拥有学科交叉融合和集成优势，形成了从基础研究到应用发展的科研集群。例如，北京物质科学研究基地是由北京地区4个研究所按照新的功能进行所际调整、重组而形成的3个创新中心的组织构架。通过政策引导、资源共享与调控、组织重点项目等措施，完成了北京物质科学科研体系的新布局，其中物理研究所和化学研究所发展迅速，新组建的理化技术研究所创新能力、成果转化能力和总体竞争能力不断增强，现已步入了快速发展阶段。

一些创新基地内研究所研究方向相近，有共同的发展目标，分布在不同地区，通过加强领导，形成在某一领域强大的研究实力。例如，我院以5个光机类研究所为基础，组建了具有法人地位的光电研究院，加强了对各研究所的统一领导，进一步发挥了大兵团作战的优势。

2推动所际结构调整，形成学科发展优势

我院对45个研究所进行了所际调整，整合成为15个研究所(院)。例如，我院将原数学研究所、应用数学研究所、计算数学与工程计算研究所和系统科学研究所整合成为数学与系统科学研究院，减少了各所原有的重复布局，集中优势力量，解决重大数学科学问题，推进数学在国民经济和社会发展中的应用研究。

3组建新的研究机构，部署新兴和交叉学科领域

瞄准世界科技发展前沿，部署新兴和交叉学科研究方向并适时组建新的研究单元。先后组建了地球环境研究所、北京基因组研究所、青藏高原研究所等研究机构。与北京大学、清华大学共同新建了国家纳米科学中心。与广东省、广州市共同筹建生物医药和健康研究院，与浙江省共同新建中国科学院浙江材料技术与工程研究所，与上海市共建小卫星工程中心，与法国巴斯德研究所共建上海巴斯德研究所。在交叉新兴学科方向新建了一批非法人研究机构，例如，在上海生命科学研究院组建了神经科学研究所和营养科学研究所。

4完成部分机构转制，面向国家和地方经济建设

我院通过实施部分事业单位整体转制，促进一批应用开发类科研机构进入市场，直接为经济建设服务。至2001年底，完成了原成都计算机应用研究所等13个单位转制为有限责任公司。

三 体制机制改革与管理创新

知识创新工程试点以来，我院坚持以改革促发展，革除了计划经济遗留的用人论资排辈、资源平均分配和管理低效率等传统弊端，建立了队伍动态更新、资源择优配置的机制，形成了以科学评价为基础的竞争发展机制。

(一) 人事制度改革

1 实行岗位聘任制度，实现竞争择优上岗

1999年，我院全面推行了“按需设岗、按岗聘任、择优上岗、动态更新”的岗位聘任制度，并于2001年停止了传统的职称评定工作，由此奠定了科技队伍竞争提高、动态更新的制度基础。

2实行项目聘用制度，促进流动队伍建设

我院自2001年起推出项目聘用制度，突破了“事业编制”的局限性，在人才使用上“不求所有，但求所用”，满足了对科研人才的动态需求。

推行 “人事代理制度”，实行人才社会化，我院正在实现所属人员由“单位人”向“社会人”的转化，并积极稳妥推进了转岗分流工作。

3实行新型分配制度，有效激励科技人员

积极推进分配制度改革，全面实行了体现绩效优先的“基本工资、岗位津贴、绩效奖励”的“三元结构”分配制度。试行了“研究所法定代表人年薪制”、特殊拔尖人才的“协议工资制”、项目聘用人员的“合同工资制”。打破了人员收入分配的“大锅饭”，有效激励了科技人员的创新积极性，提高了我院对优秀人才的凝聚力。

(二)资源配置制度改革

1 确定资源配置方针

为充分发挥资源配置的杠杆功能，保证知识创新工程试点工作的顺利实施，我院适时调整了资源配置的方针，从资源短缺时期过分强调平衡平均，调整为“整体规划、保证重点、择优支持、鼓励竞争、优化配置、动态调整”。

在实践的基础上，我院系统研究了我国科技发展的长远战略，与时俱进地提出了“绩效优先、鼓励创新、竞争向上、协同发展、创新增值”的新的资源配置方针，更加体现引导我院科技创新进入社会经济价值链，实现科技创新的增长循环。

2改革资源配置机制

我院根据资源配置方针，对资源配置机制进行了重大改革。一是坚持“发展快先支持，发展好多支持”。二是坚持对外竞争经费比例，对不能达到对外竞争经费比例的研究所，相应核减院经常性经费，并在研究所评价中减分。三是坚持重大创新项目、重要方向项目和基础设施建设项目经费院所两级匹配支持，有效调动了研究所的积极性。 四是积极进行预算管理制度的改革，运用预算手段推动事业的发展。

3加强财务管理

为规范财务管理工作，保证资金安全高效使用，我院先后制定了《中国科学院知识创新工程试点经费管理办法》、《中国科学院知识创新工程重大项目管理办法》、《中国科学院知识创新工程重要方向项目管理办法》、《中国科学院知识创新工程领域前沿项目管理办法》和《关于成立非法人研究机构的暂行规定》等一系列规章制度。我院财务管理水平逐步提高，财务制度愈加规范健全。

(三)研究所评价体系改革

我院在10余年进行研究所评价工作的基础上，进一步改革了知识创新工程试点研究所评价体系和评价方法。

1坚持“质重于量、分类导向、公开公正、科学严肃”

原则

1999-2001年，对试点研究所评价的重点是“创新任务完成情况评价”和“基础性、战略性与前瞻性”三性贡献评价。与原有体系相比，新的评价体系更关注创新任务的完成，关注导向性指标。

2002年，我院进一步调整了试点研究所评价体系，形成了包括“重大创新贡献评价”、“分类导向评价”与“基础指标测评”评价体系。

2004年，提出的“综合质量”评估，改变了过去以定量评价为主的方法，试行以同行专家定性评价为主、以基础指标评估为基础的评价方法，聘请国内外著名专家到研究所实地考察与函评相结合，逐步与国际接轨。

2建立评价结果与研究所资源配置和法人代表年薪

挂钩制度

我院通过不断改进评价体系，不断探索评价结果与资源配置挂钩方式，初步形成了与研究所创新经费和研究所法人代表年薪挂钩的制度。给评价结果排序靠前的若干个研究所增加数百万元创新经费，对评价结果排序最后的几个研究所则分别扣减10%-20%的创新经费。

(四)科技奖励制度改革

为适应国家科技奖励制度改革的要求和知识创新工程试点发展的需要，2002年，我院对科技奖励制度进行了重大改革，不再设立科技成果奖，新设“中国科学院杰出科技成就奖”，奖励在科技创新活动中做出重大科技创新成果的个人和集体。奖励对象从过去奖励科研成果转变为奖励科技人员，体现以人为本的理念，同时鼓励和倡导科研团队协作攻关。新的科技奖励体制注重原创，鼓励学科交叉系统集成。“中国科学院杰出科技成就奖”每两年评审一次，每届奖励10个以下自然人或集体。

改革评审方法，加强开放透明，改变了过去单纯由院属单位推荐的办法，增加了5名及其以上院内外具有研究员(教授)职称的同领域知名专家可以联名向院推荐的规定；改变了过去院科技奖评审全部是院内专家，规定在评审人员组成上院外科技专家的比例不能低于10%；聘请国外同行专家对初评结果进行书面评价，作为总评的重要依据。

(五) 经营性国有资产管理改革

1明晰产权，保证经营性国有资产保值增值

我院根据国家有关规定，结合企业改制工作，对已有企业的产权进行界定，截至2003年底，共有384家院所投资企业完成了股份制改造，占经批复需改制企业的94.5%。

规范了对新投资企业的产权管理。今后院、所投资企业，主要以科技成果形成的专利权、专有技术等无形资产和自有经营性收入投资入股，依据《中华人民共和国公司法》设立股份制公司。

实现了经营性国有资产的保值增值。1993-2003年院直接投资企业共上缴院利费8.5亿元，是累计投资的2.6倍。截至2003年末，院、所投资企业所有者权益总额达154亿元，其中院属权益86亿元。1996-2003年，研究所投资企业上缴各研究所利费共计10.3亿元。

2优化结构，推进院所投资企业社会化进程

我院在基本完成院、所投资企业股份制改造的基础上，继续深化改革,以产权社会化为突破口，促进与社会优势资源的优化组合，加快高技术产业的规模化发展。

近两年来，我院在推进企业股权社会化方面取得了一定进展，如整体出让了深圳科健集团、北京中科大洋科技发展有限公司和科智国际技术合作公司等公司的股权，长春应用化学研究所出让了所持长春热缩公司1.32亿元股权等。

我院2004年8月出台了《关于加快院、所投资企业社会化改革的决定》，明确加快企业社会化改革的主要任务是，从2005年起，已存续5年及以上的院、所投资企业，必须抓紧推进股权社会化，原则上，2010年前院、所持股比例降至50%以下。决定自2006年起，我院将企业社会化改革及经营性国有资产营运绩效增列为研究所促进高技术产业发展工作的主要评价指标之一。

3事企分开，加强经营性国有资产经营管理

积极探索经营性国有资产监管体系的有效途径。2002年我院出资设立了“中国科学院国有资产经营管理有限责任公司”。该公司代表我院行使国有资产出资人权利，以资产为纽带，对持股企业行使国有资产管理职能，提高我院对经营性国有资产的资本运作能力，确保国有资产增值。公司持股企业27家，其中控股企业20家。公司主要从事国有资产的经营与管理，包括国有股权和产权的管理、收购与转让、兼并与置换、投资、资产托管等业务。

(待续，一工整理)