汶川地震，震惊全国。这场突如其来的灾难造成了灾区同胞巨大的创伤和痛苦，也震撼和牵动着中科院南京地理与湖泊研究所每个职工和研究生的心灵。南京地理与湖泊研究所在所党委的领导下积极行动起来，及时召开了抗震救灾专门会议，传达了中国科学院“关于做好抗震救灾有关工作的紧急通知”和江苏省委省政府有关抗震救灾工作的意见，全面布置抗震救灾的各项工作，会议要求各职能部门和各研究室全力以赴积极投入到这次抗震救灾中去。

南京地理与湖泊研究所有关部门一方面通过在四川省任科技副职的本所同志全面了解灾情，同时在全所范围内调查统计是否有职工、研究生和博士后目前还在灾区出差等情况；另一方面由所工会积极组织捐款，全所职工包括离退休人员以及研究生(博士后)从四面八方涌向所工会办公室纷纷捐款，其中包括远在海外的我所退休职工也纷纷打来电话委托所里代为捐款。第一批捐助的款项人民币近3万元已送交江苏省红十字会，目前捐款还在继续中。