在党中央和国务院的领导下，中国科学院的知识创新工程试点已历经六年，正在全面推进。在这一历史时期，中国科学院确立了新时期办院方针，即“面向国家战略需求，面向世界科学前沿，加强原始科学创新，加强关键技术创新与集成，攀登世界科技高峰，为我国经济建设、国家安全和社会可持续发展不断做出基础性、战略性、前瞻性的重大创新贡献”。为深入贯彻落实新时期办院方针，激励科技人员的创新意识，大力营造人才辈出的体制环境，根据国家科技奖励改革的精神，中国科学院决定进一步深化科技奖励改革：

第一，停止评审中国科学院科技成果奖，集中力量做好推荐国家科技奖的工作。通过不断推出高水平的重大成果，激励全院的创新力和竞争力，提升创新的目标与层次，为提高我国科技创新能力和国家核心竞争力，不断做出重大科技创新贡献。

第二，鼓励全院各研究所融入社会、面向用户、参与竞争、扩大影响，积极申报省级和国防、公安、安全部门科技奖，为地区经济的发展和国家安全、社会进步做出更大贡献。

第三，设立中国科学院杰出科技成就奖，主要奖励在科技创新活动中做出重大科技创新成果的个人和集体。将全院科技人才的注意力、创造力引导与组织到新时期办院方针确定的目标上，动员与组织到全面建设小康社会、加快推进社会主义现代化目标上来。