为深入推进知识创新工程，从2009年初开始着手研究制定《知识创新工程2020：科技创新跨越方案》（简称“创新2020”）。方案充分吸纳了“创新2050”路线图研究成果，充分吸纳了各科技创新基地和研究所战略研究成果，充分吸纳了全院各研究所改革发展的实践经验，明确了中科院未来10年的发展旗帜、发展战略、发展目标、战略重点和重大改革举措，是中科院发展的宏伟蓝图和行动纲领。

“十二五”规划研究制定工作全面推进。按照院“十二五”规划编制工作的总体部署，依据“创新2020”，形成院“十二五”发展规划纲要框架稿，并广泛征求全院各单位的意见，冬季党组扩大会议审议了规划纲要框架稿。