4月29日，北京市总工会授予北京基因组研究所“首都劳动奖状”。

冬末初春，一种人类陌生的病毒——传染性非典型肺炎肆虐我国广东、北京等部分地区，威胁这人民的生命健康。疫情万分严峻，如何控制传染途径并攻克“非典”病毒摆在中国科学家面前。

中国科学院北京基因组研究所暨华大基因研究中心全体员工认识到，作为一直生命科学的“生力军”，对制服“非典”病毒有着义不容辞的责任和义务。中心领导果断决策，部署科研行动计划、成立专门领导小组。全体员工迅速动员，不顾个人安危、冒着被感染的危险多次奔赴广东、内蒙等疫区取样，获取“非典”第一手资料。所有人员不分昼夜24小时待命，在与兄弟单位共同配合下，大家夜以继日，在48小时内完成了4株不同病毒的测序，并在4天之内完成了酶联免疫试剂盒的研制。

4月20日，中共中央总书记、国家主席胡锦涛同志亲自视察了北京基因组研究所，并接见了中心全体员工。胡锦涛主席指出：在这样一个紧急关头，广大科研人员想中央之所想，急抗病之所急，办群众之所急，办群众之所需，以对人民高度负责的精神和严谨的科学态度；夜以继日、顽强奋战，合力攻关，做了大量艰苦细致的研究工作，取得了宝贵的成果，这对战胜非典型肺炎具有重要意义。胡锦涛同志勉励大家再接再厉、坚定信心、继续发扬爱国奉献、勇攀高峰、为民造福的精神，为战胜疫病、保护人民的身体健康和生命安全做出更的贡献。现在攻克“非典”的科研计划仍在不间断的进行着，全体研究人员决心以科学的态度、饱满的热情，全力投入对抗“非典”这场战役，希望为战胜“非典”做出更大的贡献。

回顾华大基因研究中心三年的风雨历程，这是硕果累累。从“人类基因组计划”到水稻基因组“工作框架图”和“精细图”的完成。这一切对促进人类健康和解决世界粮食问题具有重大意义，得到国际、国内同行的高度评价，并多次受到江泽民主席、朱镕基总理以及科技部徐冠华部长等领导的肯定。以上三项成果分别被评为“2001年度中国十大科技进展”第二、三位和“2002年度中国十大科技进展”第一位，“1%项目”获得国家自然科学二等奖，“水稻基因组测序完成”被《科学》杂志选为“2002年度全球十大科技突破”之一；2002年9月杨焕明、于军等7人荣获香港“求是”基金会颁发的“求是杰出科技成就集体奖”，2002年11月杨焕明和于军双双被享有世界声誉的《科学美国人》杂志评为“全球科研领袖”(共3人)；2003年3月“中国杂交水稻基因组研究团队”被中国科学院评为“2001—2002年度重大创新贡献团队。