为了总结2001年全所的科研工作，加强研究组间的学术交流，促进所的整体科研水平的提高，生化与细胞所2001年度学术年会于2002年1月31日—2月1日在青浦朱家角举行，共有200多名研究人员和研究生参加了会议，中科院生物局局长助理田彦、处长韩华、上海市科委副主任李逸平、上海市生命科学研究院院长裴钢、副院长甘荣兴等到会。31日下午常务副所长李林主持了简短的开幕式，上海市生命科学研究院党委书记、生化与细胞所所长李伯良致词，来宾韩华、李逸平、裴钢等领导讲话，生化与细胞所副所长阮康成对所的工作进行了回顾总结。李伯良所长、阮康成副所长从投入与产出比中分析了2001年取得的成绩，在国家任务的争取和落实方面：生化与细胞所2001年在研课题200多项，到位经费4000多万，平均每个课题20万左右。2001年生化与细胞所申请项目多，命中率高，如申请国家自然科学基金委重点和面上项目41项，批准17项，命中率为40%，而平均值为13%。申请国家杰出青年基金4项，批准3项。申请863项目30项，批准17项；批准 973子课题2项等。从产出方面来看：2001年发表文章267篇，在SCI收录的杂志上发表论文196篇，不仅数量上而且在高质量文章数上均较以前有明显增加, 其中一篇发表在《Science》上。根据信息统计中心的统计，原上海生化所连续两年排第11位，考虑到生化所、细胞所已于2000年4月整合，生化与细胞所两年排名应为第8位，在生物类研究所排名为第1位；2001年获得6项成果，其中1项为国家自然科学二等奖、申请专利18项，获得授权专利13项；在人才队伍建设方面，张友尚、张永莲研究员新当选为院士，2位研究生获中科院院长特别奖。30位研究生获各类冠名奖，3位研究员获中科院优秀导师奖。
    会议召开前，所有研究组撰写了本年度工作报告(300-500字)，编印了2001年年会报告摘要、年度工作汇编本，本次年会根据新调整的蛋白质、核酸、细胞、生物技术四个领域安排了学术报告，其中三个基础领域有三个重点实验室。领域负责人李林、金由辛、朱学良、阮康成分别主持了两天的报告。各领域相关的研究组长共有14人汇报了最新的工作进展，另外特邀了神经所郭爱克研究员做了《果蝇在面临矛盾时的抉择行为研究》、健康中心盛慧珍研究员做了《干细胞研究—对应用和基础学科的影响》的报告，两个特邀报告对生化与细胞所新研究领域的拓展有很好的启发，同时对所内外的学术交流、促进学科交流，起到了很好的作用。本次年会对蛋白质组研究、神经元、信号转导的分子机制、基因的表达与功能、胰岛素、肝癌细胞、细胞分化、生物技术的发展与未来的生物医药等方面进行了汇报和讨论，与会者提问踊跃，台上台下交流热烈，形成了良好的学术氛围。正如常务副所长李林在总结时所说，本次年会时间虽短，但内容精彩，达到了预期的目的。