系统生物学是从整体的角度应用系统论和实验、计算方法对生物有机体内大量分子及其之间的相互作用网络进行动态分析的交叉学科，而传统实验生物学往往仅以一个或几个分子作为研究对象，在简化了的实验条件中进行研究。因此，系统生物学方法和技术在对复杂疾病的发生机制以及诊疗方法的研究中更有优势。

今年6月，Journal of Molecular Cell Biology出版了由中科院上海生科院陈洛南研究员和吴家睿研究员编辑组织的“复杂疾病的系统生物学研究”专刊，展示了国内外研究人员应用系统生物学对前列腺癌、卵巢癌、肝癌、糖尿病以及神经系统疾病等复杂疾病的发病机制、预防、诊断及治疗方法进行的部分研究成果。

专刊中Kazuyuki Aihara课题组课题组等利用数学模型分析了经过间歇性雄激素阻断治疗的前列腺癌患者体内前列腺特异性抗原PSA的动态变化特征，并发现复发率与PSA呈正相关，这为治疗方案的优化提供了指导依据。Makoto Asashima课题组系统分析了成体嗅球源性神经干细胞对糖尿病、神经类疾病以及精神障碍等的治疗作用。中国陈洛南课题组等通过对慢性乙型和丙型肝炎患者的基因组共网络表达进行模块化，然后系统地对比分析，揭示了两种不同病毒引发的肝癌的差异化发展模式，发现对于乙型肝炎，凋亡模块可以致癌，而丙型肝炎中引发癌症的是去凋亡模块。Kwang-Hyun Cho课题组等通过系统生物学方法，通过理论分析与实验相结合的方法研究发现在多种信号途径（ERK和PI3K信号途径）的复杂网络背景下，MEK抑制剂的作用效果趋于多元化，此结果为临床的联合疗法提供了实验依据。

Sunghoon Kim课题组通过研究还发现AIMP2-DX2能够竞争性结合TRAF2，进一步调节NF-kB的活性，因此可以基于AIMP2-DX2为靶点进行化疗，避免直接以容易在化疗中被激活的NF-kB作为化疗靶点而使肿瘤细胞产生耐药性。Ying Xu课题组通过系统生物学方法，对7种实体癌的基因组表达图谱进行分析，建立了一个肿瘤（加速）生长模型，并提出缺氧驱动并加速癌症生长的分子机制，为肿瘤的防治提供了新思路。李亦学课题组首次提出了基因表达时程保守指数（TiCoGE）的概念，并根据TiGoGE算法分析了前列腺癌多基因表达水平的动态关系。