2008年12月18日，“中国科学院华罗庚数学重点实验室”和“中国科学院随机复杂结构与数据科学重点实验室”经中国科学院批准正式成立。

数学研究所所长周向宇任“中国科学院华罗庚数学重点实验室”主任，杨乐院士任学术委员会主任。实验室的成员由数学所和应用数学研究所部分科研人员构成，实验室集中于数学结构及其交叉应用的研究。应用数学研究所所长巩馥洲任“中国科学院随机复杂结构与数据科学重点实验室”主任，马志明院士任学术委员会主任。实验室的成员由应用数学研究所从事相关领域和方向研究的科研人员构成。主要从事生命科学、经济金融与信息系统中随机复杂结构的建模与推断，以及随机复杂结构与数据的基础理论和方法。