中国科学院响应国家西部大开发、振兴东北老工业基地、天津滨海新区开发等战略部署，自2003年，先后启动了“东北振兴科技行动计划”、科技援藏（西藏）工程、科技支黔（贵州）工程、科技支甘（甘肃）工程、科技支青（青海）工程、科技支新（新疆）工程、支持天津滨海新区建设科技行动计划和三峡创新工程等系列院地合作科技专项工程。