自“非典”疫情在全国各地陆续发生，新疆分院及所、站都非常关注。新疆分院在疫情初期立即成立了“新疆分院预防非典工作领导小组”，下设办事机构，安排专人开展工作。同时积极开展各类宣传工作，及时传达自治区党委防非工作会议精神，对分院系统防非工作提出安排和要求。各所、站及直属单位也相继成立了组织机构。在分院统一领导下，各办公场所、家属区都张贴了宣传通告和急报电话；每个住宅楼单元都贴有防“非典”宣传材料；分院及各所、站通过召开职工大会、宣传板报等形式向职工宣传非典的特点、传染的途径、预防办法，要求职工养成良好的工作、生活习惯。

    分院积极采取应对措施，安排有关人员每天两次对办公场所、住宅楼道进行消毒；在分院接待中心设立隔离区；实行每天零报告制度，按时向地方政府、中科院人教局、社区进行报告；对从疫情区返回的职工及家属进行了解、登记并隔离14天进行观察。各研究所对回单位工作的单身职工和研究生，提早掌握情况，提前准备好生活用品并专门安排房间进行隔离，确保防非工作万无一失。

    为消除疾病传染源，分院系统在有关部门的统一安排下，多次对环境卫生进行清扫，重点整治卫生死角，集中清运各类垃圾，并拟通过增设垃圾桶、新建垃圾站等措施，从根本上消灭卫生死角。

    为筑起防非工作的有效防线，分院要求各单位对公房、私房出租进行一次彻底的摸查，对每户流动人员及租房经商人员进行造册登记，掌握第一手资料。按照乌鲁木齐市有关规定，实行谁出租房屋、谁收益、谁负责制度，对出租房屋单位及个人提出责任要求，确保不留工作死角和盲区。