建院以来，中国科学院在不同的历史阶段先后提出过四次办院方针，它们对中国科学院的发展都发挥了重要的指导作用。2002年，中国科学院按照“既要保持一定的历史连续性，更要把握时代特点，与时俱进，面向未来”的思路，提出了新时期的办院方针，即：“面向国家战略需求，面向世界科学前沿，加强原始科学创新，加强关键技术创新与系统集成，攀登世界科技高峰，为我国经济建设、国家安全和社会可持续发展不断做出基础性、战略性、前瞻性的重大创新贡献”。

　　这个办院方针继承了中国科学院历次办院方针的共同特点，将为国家需求服务与科学技术发展有机结合，同时也充分反映了我国实现第三步发展目标对科学技术新的需求和中国科学院在国家创新体系中的战略定位。在新时期办院方针指导下，全院同志在中国科学院改革与发展的重大问题上形成了高度共识。一是坚持将面向国家战略需求放在首位，并将面向国家战略需求与面向世界科学前沿有机结合；二是坚持大力加强原始科学创新，努力攀登世界科学高峰；三是坚持大力加强关键技术创新与系统集成，迎接全球化知识经济时代的挑战；四是坚持大力加强中国科学院在资源、环境、生态等方面的研究，为我国社会可持续发展战略的科学决策与有效实施做出重大贡献；五是加强科技创新成果的转化，积极孕育、孵化和发展高技术产业，为我国产业结构调整和保持经济快速增长做出直接贡献。