随着箭船分离，配备有直升机和特殊车辆的火箭残骸搜索小分队迅即在各预定落区开始寻找火箭“黑匣子”和箭体残骸。

大约10分钟的飞行中，“长征”二号F型火箭完美地完成了抛逃逸塔、助推器分离、一二级分离、抛整流罩的一系列动作。把“神舟”五号载人飞船成功送进预定轨道后，这枚高可靠性、高安全性和高质量的火箭结束了它在中国首次载人航天飞行中所担负的历史使命。

按照计划，火箭的逃逸塔、助推器、芯一级和整流罩将先后落在从内蒙古巴丹吉林沙漠到山西榆林地区的4个落点，全线距离近800公里。

“搜索小分队的一个重要任务是寻找火箭的磁记录仪。”应急救生大队负责人马兵其说。磁记录仪就是人们通常说的“黑匣子”，是记录火箭飞行数据的重要仪器，有助于了解遥测系统无法得到的一些数据。

点火飞行160秒后火箭一二级分离，放置在火箭芯一级内的磁记录仪也随着箭体落至内蒙古鄂托克旗附近地区。

有着圆柱形外观和白底红条醒目花纹的磁记录仪找起来并不容易。应急救生大队副大队长刘涛回忆说，此前的4次“神舟”无人飞船发射中，有3次磁记录仪落地时均已离开箭体，加上草场密、风沙大，搜索分队用了不少时间才最后找到。

刘涛说，磁记录仪将送至有关部门进行数据分析。火箭的其他部分残骸，也将运回酒泉卫星发射中心或者做就地引爆解体处理。这是为了避免影响环境和当地居民的生活。