退居二线后，侯祥麟依然闲不住。在中石化总公司成立前，总经理陈锦华曾找他商量，成立技术经济顾问委员会的事宜。侯祥麟推荐了很多专家，在石化总公司成立的同时，这个技术经济顾问委员会便宣告成立了，侯祥麟成为首席顾问。随后，又负责起委员会的技术组工作。

80年代，中国开始大量引进国外的先进技术设备，引进大幅度增加了生产能力，提高了生产技术水平，自然可喜。但是侯祥麟说他是喜忧参半。因为引进对于提高我国科研的起点和自力更生能力，却助益不大。尤其是当时引进的重点是成套装置、生产线、单机等硬件，购买专利、技术等软件的比例很小。当时流行“交钥匙”，就是国内将所需的成套设备承包给国外公司，让国外公司交整套装置。侯祥麟认为“交钥匙”很不划算，自己花了钱，却被外国人拿走了技术，一些国外的工程公司都是通过承包中国的项目而学习的。所以他多次建议，一定要把我们自己的工程公司搞起来。在推动国产化的过程中，他主张自己来搞，力争不引进，尤其不搞成套设备引进。

就这样，技术组在侯祥麟的带领下，踏踏实实地做成了几件大事。他主抓了石化工业设备的国产化和创新技术的开发，在国内建成了示范性乙烯裂解炉，并最终获得成功；还建成了重油的高压加氢裂化这一重大设备。

蒸汽裂解制取乙烯是传统生产工艺，在世界上一直没有被成功地突破，革新这种传统工艺就成了侯祥麟一个的夙愿。经过反复比较和研究，侯祥麟提出用流化床方法裂解重质原料油生产烯烃，得到支持后，工艺研究和催化剂试制以出人意料的速度取得成功，接着小型工业试验也取得成功，就这样，中国独创了“催化裂解”工艺技术。该技术还出口到了泰国，成为中国第一套出口的炼油成套技术。

1990年，催化裂解成功地进行工业化试验后，引起世界科技界和石油化工界的重视，很快在中国、美国、欧洲和日本等国批准了专利。还先后获得中国专利创造发明金奖、国家发明一等奖等。

在侯祥麟的带领下，技术组每年都要开会研究石化科技的重大问题，并提出建议。侯祥麟自己也提出了很多重要、宝贵的建议。80年代中后期，是中国以生产为中心的时期，侯祥麟却早早建议石化总公司建加油站，拓宽销售渠道。有人提出我们要跟外国的大石油公司论仲伯比高低，侯祥麟就提出要以科技、设计、生产三个指标，来与外国公司做较量。他的远见给中国石油工业带来很多启示。