加快打造原始创新策源地,加快突破关键核心技术,努力抢占科技制高点,为把我国建设成为世界科技强国作出新的更大的贡献。

——习近平总书记在致中国科学院建院70周年贺信中作出的“两加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向经济主战场、面向国家重大需求、面向人民生命健康,率先实现科学技术跨越发展,率先建成国家创新人才高地,率先建成国家高水平科技智库,率先建设国际一流科研机构。

——中国科学院办院方针

首页 > 科研进展

东北地理所等在大豆基因组解析研究中获进展

2021-07-14 东北地理与农业生态研究所
【字体:

语音播报

  中国科学院东北地理与农业生态研究所研究员冯献忠课题组等选择1份东北野生大豆、7份我国代表性栽培种,结合平均50×的三代测序和Hi-C测序,组装了高质量大豆参考基因组。组装的8个大豆基因组大小范围为986.1-1001.3Mb,Contig N50=1.4-6.1Mb,BUSCO完整性评估为96.7%-97.3%;结合同源注释、从头注释、转录组辅助注释,在8个大豆中注释得到57286-58392个基因。

  基于8个高质量的大豆基因组,研究团队鉴定到186-427万个SNP,44-92万个InDel,11750-25330个大的InDel,706-3006个易位事件,200-413个倒位事件。在野生大豆中鉴定到60个栽培大豆中缺失或变短的基因,以及野生大豆种质缺失或变短却在栽培中存在的185个基因。

  相关研究成果以Eight soybean reference genome resources from varying latitudes and agronomic traits为题,发表在Scientific Data上。该研究为大豆结构变异与遗传育种研究提供了新的参考基因组。研究工作得到国家重点研发计划、中科院重点研究项目、山东省“泰山学者”项目等的资助。

图1.8个测序大豆品种

图2.8个测序大豆品种基因组差异比较

打印 责任编辑:侯茜

扫一扫在手机打开当前页

© 1996 - 中国科学院 版权所有 京ICP备05002857号-1 京公网安备110402500047号 网站标识码bm48000002

地址:北京市西城区三里河路52号 邮编:100864

电话: 86 10 68597114(总机) 86 10 68597289(总值班室)

编辑部邮箱:casweb@cashq.ac.cn

  • © 1996 - 中国科学院 版权所有 京ICP备05002857号-1 京公网安备110402500047号 网站标识码bm48000002

    地址:北京市西城区三里河路52号 邮编:100864

    电话: 86 10 68597114(总机) 86 10 68597289(总值班室)

    编辑部邮箱:casweb@cashq.ac.cn

  • © 1996 - 中国科学院 版权所有
    京ICP备05002857号-1
    京公网安备110402500047号
    网站标识码bm48000002

    地址:北京市西城区三里河路52号 邮编:100864
    电话:86 10 68597114(总机)
       86 10 68597289(总值班室)
    编辑部邮箱:casweb@cashq.ac.cn