加快打造原始创新策源地,加快突破关键核心技术,努力抢占科技制高点,为把我国建设成为世界科技强国作出新的更大的贡献。

——习近平总书记在致中国科学院建院70周年贺信中作出的“两加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向经济主战场、面向国家重大需求、面向人民生命健康,率先实现科学技术跨越发展,率先建成国家创新人才高地,率先建成国家高水平科技智库,率先建设国际一流科研机构。

——中国科学院办院方针

首页 > 科研进展

新疆生地所解译出真盐生植物异子蓬全基因组

2019-09-18 新疆生态与地理研究所
【字体:

语音播报

  异子蓬(Suaeda aralocaspica)是一年生真盐生植物,主要分布于中亚,在中国仅产于新疆。异子蓬在耐盐特性、光合作用和种子性状等方面具有重要的研究价值。异子蓬能够在表层土壤含盐量超过10%的环境中正常生长,种子萌发耐盐性超过1000mmol/L NaCl。异子蓬的叶片、花被片和果实都能在单个细胞内完成C4光合作用,这与典型的具有花环结构(Kranz)C4植物不同。另外,异子蓬能在同一果序的不同位置产生棕色和黑色两种类型的种子。

  20199月,中国科学院新疆生态与地理研究所研究员田长彦团队完成了异子蓬全基因组的测序、组装,成功绘制了异子蓬的全基因组草图。这是目前世界上首个测序的真盐生植物和单细胞C4植物。组装完成的异子蓬基因组大小约452Mb,占预估异子蓬基因组大小的96.8%。共组装得到4033scaffoldsscaffold N501.83Mb。结合MAKER注释、同源蛋白序列注释以及来自不同组织的转录组数据,该研究共注释得到29604个蛋白编码基因,1651个长非编码RNA21 microRNA。基因组重复序列比例为38.41%,其中48.5%LTR逆转录转座子。根据BUSCO分析,基因组完整性为89.5%。此外,该研究还构建了全长146654 bp的完整叶绿体基因组。

  该研究获得新疆维吾尔自治区重点研发计划项目、国家自然科学基金和国家重点研发计划的资助。以上研究成果以A draft genome assembly of halophyte Suaeda aralocaspica, a plant that performs C4 photosynthesis within individual cells 为题发表于GigaScience

    论文链接

打印 责任编辑:叶瑞优

扫一扫在手机打开当前页

© 1996 - 中国科学院 版权所有 京ICP备05002857号-1 京公网安备110402500047号 网站标识码bm48000002

地址:北京市西城区三里河路52号 邮编:100864

电话: 86 10 68597114(总机) 86 10 68597289(总值班室)

编辑部邮箱:casweb@cashq.ac.cn

  • © 1996 - 中国科学院 版权所有 京ICP备05002857号-1 京公网安备110402500047号 网站标识码bm48000002

    地址:北京市西城区三里河路52号 邮编:100864

    电话: 86 10 68597114(总机) 86 10 68597289(总值班室)

    编辑部邮箱:casweb@cashq.ac.cn

  • © 1996 - 中国科学院 版权所有
    京ICP备05002857号-1
    京公网安备110402500047号
    网站标识码bm48000002

    地址:北京市西城区三里河路52号 邮编:100864
    电话:86 10 68597114(总机)
       86 10 68597289(总值班室)
    编辑部邮箱:casweb@cashq.ac.cn