从人类骨骼中提取的古DNA改写了日本的早期历史，它强调了日本现代人口的三重遗传起源。这一发现完善了先前公认的日本祖先双基因组观点。
　　12个新测序的古代基因组表明，日本现代人口确实有早期本地绳文时代渔猎采集者以及弥生时代移居农民的基因特征，但也有与古坟（Kofun）时代相关的第三个基因成分。日前，相关研究成果发表于《科学进展》。
　　日本列岛被人类占领了至少3.8万年，但日本只是在过去3000年中经历了快速转变。此前长期存在的假设认为，日本人口有双重祖先：约1.6万年前至3000年前居住于此的本土绳文渔猎采集者；以及后来从亚洲大陆移民到日本的弥生农民，后者生活在约公元前900年至公元300年的日本。但来自农耕时代之前和之后的人类骨骼的12个新测序古代日本基因组，也确定了古坟时期（大约公元300年至700年）东亚祖先的涌入。
　　爱尔兰都柏林圣三一大学医学院助理教授Shigeki Nakagome领导了这项研究，该研究汇集了来自日本和爱尔兰的跨学科研究人员。
　　“随着越来越多的古代文物的出现，研究人员对绳文、弥生和古坟时期的文化了解得越来越多，但在这项研究之前，我们对农业转型和后期国家形成阶段的遗传起源和影响知之甚少。”Nakagome说。
　　“现在，我们知道，来自不同阶段的祖先对今天日本人口的形成作出了重大贡献。简言之，我们有了一个全新的日本基因组起源模型。”Nakagome表示。
　　除了最重要的发现外，分析还指出，在几千年的时间里，绳文人的有效人口数量一直保持在1000左右，与2万年前至1.5万年前的日本人口有着很大差异。这一时期，日本由于海平面上升而在地理上变得更加孤立。
　　在大约2.8万年前的最后一次冰河期开始时，古人们可以通过朝鲜半岛进入日本列岛，这使得两者间的往来成为可能。1.7万年前至1.6万年前海平面上升，朝鲜海峡不断扩大，这可能导致随后的绳文血统与亚洲大陆其他种群隔离。这些时间框架也与绳文陶器生产的最古老证据相吻合。
　　在弥生时期开始种植水稻前，数千年来，绳文人在日本有自己独特的生活方式和文化。“我们的分析清楚地发现，他们是一个基因截然不同的群体，所有样本个体之间具有异常高的相似性，即使是那些从不同岛屿的遗址中挖掘出来的年龄跨度千百年的个体也是如此。”都柏林圣三一大学博士Niall Cooke解释道，“这些结果表明，他们与大陆其他地区长期隔离。”
　　农业的传播通常以人口更替为标志，正如欧洲大部分地区新石器时代过渡期记载的那样，在许多地区，狩猎—采集人口对农业的贡献微乎其微。然而，研究人员发现的遗传学证据表明，史前日本的农业转型是同化过程而不是替代过程，本土绳文人和新移民对水稻种植的贡献几乎相等。
　　此外，考古证据表明，在弥生古坟过渡时期，日本出现了新的大型定居点，这些人很可能来自朝鲜半岛南部。
　　“我们对现代日本人复杂起源的深入了解再次显示了古代基因组学的力量，它可以揭示人类史前的新信息，而这些信息在其他情况下是无法看到的。”都柏林圣三一大学人口遗传学教授Dan Bradley补充说。
　　相关论文信息：https://doi.org/10.1126/sciadv.abh2419